Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms