Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms