Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef6A2A8M8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 952.8 ms