Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Itgb4A2A863 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Itgb4A2A863 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Itgb4A2A863 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms