Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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