Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Mrpl40Q9Z2Q5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Mrpl40Q9Z2Q5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Mrpl40Q9Z2Q5 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Mrpl40Q9Z2Q5 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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