Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms