Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Pdpk1Q9Z2A0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Pdpk1Q9Z2A0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Pdpk1Q9Z2A0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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