Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uso1Q9Z1Z0 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms