Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip6Q9Z1Y4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms