Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Lgr5Q9Z1P4 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Lgr5Q9Z1P4 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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