Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slfn1Q9Z0I7 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slfn1Q9Z0I7 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slfn1Q9Z0I7 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slfn1Q9Z0I7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slfn1Q9Z0I7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slfn1Q9Z0I7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slfn1Q9Z0I7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slfn1Q9Z0I7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slfn1Q9Z0I7 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slfn1Q9Z0I7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slfn1Q9Z0I7 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms