Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nek3Q9R0A5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nek3Q9R0A5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nek3Q9R0A5 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nek3Q9R0A5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nek3Q9R0A5 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nek3Q9R0A5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nek3Q9R0A5 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Nek3Q9R0A5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Nek3Q9R0A5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Nek3Q9R0A5 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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