Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Col4a4Q9QZR9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Col4a4Q9QZR9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Col4a4Q9QZR9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Col4a4Q9QZR9 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Col4a4Q9QZR9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Col4a4Q9QZR9 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Col4a4Q9QZR9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Col4a4Q9QZR9 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms