Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms