Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Rdh11Q9QYF1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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Rdh11Q9QYF1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Rdh11Q9QYF1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Rdh11Q9QYF1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Rdh11Q9QYF1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Rdh11Q9QYF1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Rdh11Q9QYF1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Rdh11Q9QYF1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Rdh11Q9QYF1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Rdh11Q9QYF1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Rdh11Q9QYF1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Rdh11Q9QYF1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Rdh11Q9QYF1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Rdh11Q9QYF1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Rdh11Q9QYF1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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