Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms