Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrfQ9JM73 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SrfQ9JM73 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SrfQ9JM73 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
SrfQ9JM73 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
SrfQ9JM73 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.39
SrfQ9JM73 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrfQ9JM73 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrfQ9JM73 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrfQ9JM73 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrfQ9JM73 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrfQ9JM73 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrfQ9JM73 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms