Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rabgef1Q9JM13 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rabgef1Q9JM13 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rabgef1Q9JM13 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rabgef1Q9JM13 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Rabgef1Q9JM13 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Rabgef1Q9JM13 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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