Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Tgm1Q9JLF6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Tgm1Q9JLF6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Tgm1Q9JLF6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms