Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Hmgn5Q9JL35 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Hmgn5Q9JL35 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Hmgn5Q9JL35 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Hmgn5Q9JL35 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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