Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms