Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Usp29Q9ES63 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Usp29Q9ES63 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Usp29Q9ES63 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp29Q9ES63 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp29Q9ES63 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp29Q9ES63 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp29Q9ES63 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp29Q9ES63 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp29Q9ES63 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp29Q9ES63 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Usp29Q9ES63 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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