Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

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Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms