Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD8

Parvg, Gamma-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvgQ9ERD8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ParvgQ9ERD8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms