Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Vmn1r160-201ENSMUST00000171745 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm42857-201ENSMUST00000200823 339 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm45345-201ENSMUST00000211427 555 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Olfr120-201ENSMUST00000077498 993 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm15895-201ENSMUST00000157018 731 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm23059-201ENSMUST00000158978 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 AL672010.1-201ENSMUST00000215182 1246 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Olfr1200-201ENSMUST00000099811 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Olfr1082-201ENSMUST00000215600 1620 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm2707-201ENSMUST00000188979 714 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm44869-201ENSMUST00000208836 357 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 AC113305.1-201ENSMUST00000214664 724 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms