Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Smg9Q9DB90 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Smg9Q9DB90 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Smg9Q9DB90 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Smg9Q9DB90 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Smg9Q9DB90 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Smg9Q9DB90 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Smg9Q9DB90 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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