Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Tmem239Q9DA47 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms