Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9DA42 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9DA42 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9DA42 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9DA42 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9DA42 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9DA42 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9DA42 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9DA42 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9DA42 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9DA42 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9DA42 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9DA42 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9DA42 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9DA42 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9DA42 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9DA42 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9DA42 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9DA42 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9DA42 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9DA42 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9DA42 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9DA42 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9DA42 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9DA42 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9DA42 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9DA42 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9DA42 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9DA42 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9DA42 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9DA42 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9DA42 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9DA42 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9DA42 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9DA42 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9DA42 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9DA42 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9DA42 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9DA42 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9DA42 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9DA42 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9DA42 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9DA42 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9DA42 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9DA42 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9DA42 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9DA42 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9DA42 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9DA42 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9DA42 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9DA42 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9DA42 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9DA42 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9DA42 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9DA42 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9DA42 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9DA42 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9DA42 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9DA42 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9DA42 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9DA42 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9DA42 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9DA42 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9DA42 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9DA42 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9DA42 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9DA42 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9DA42 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9DA42 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9DA42 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9DA42 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9DA42 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9DA42 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q9DA42 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9DA42 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9DA42 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9DA42 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9DA42 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9DA42 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9DA42 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9DA42 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9DA42 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9DA42 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9DA42 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9DA42 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9DA42 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9DA42 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9DA42 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9DA42 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9DA42 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9DA42 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9DA42 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9DA42 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9DA42 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9DA42 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9DA42 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9DA42 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9DA42 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9DA42 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9DA42 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms