Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms