Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf13cQ9D8D0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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