Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fip1l1Q9D824 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fip1l1Q9D824 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fip1l1Q9D824 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fip1l1Q9D824 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fip1l1Q9D824 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fip1l1Q9D824 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fip1l1Q9D824 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms