Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9D7E4 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9D7E4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms