Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tube1Q9D6T1 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tube1Q9D6T1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tube1Q9D6T1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tube1Q9D6T1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tube1Q9D6T1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tube1Q9D6T1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tube1Q9D6T1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tube1Q9D6T1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tube1Q9D6T1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tube1Q9D6T1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tube1Q9D6T1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tube1Q9D6T1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tube1Q9D6T1 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Tube1Q9D6T1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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