Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms