Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms