Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PrameQ9D4Z5 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PrameQ9D4Z5 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PrameQ9D4Z5 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PrameQ9D4Z5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PrameQ9D4Z5 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PrameQ9D4Z5 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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