Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Snrnp35Q9D384 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Snrnp35Q9D384 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Snrnp35Q9D384 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Snrnp35Q9D384 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Snrnp35Q9D384 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Snrnp35Q9D384 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Snrnp35Q9D384 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Snrnp35Q9D384 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Snrnp35Q9D384 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Snrnp35Q9D384 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snrnp35Q9D384 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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