Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snapc3Q9D2C9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms