Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1lQ9D1E5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms