Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Zbed3Q9D0L1 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Zbed3Q9D0L1 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Zbed3Q9D0L1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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