Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ccdc47Q9D024 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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