Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Shmt2Q9CZN7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Shmt2Q9CZN7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Shmt2Q9CZN7 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Shmt2Q9CZN7 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Shmt2Q9CZN7 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Shmt2Q9CZN7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Shmt2Q9CZN7 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Shmt2Q9CZN7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Shmt2Q9CZN7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Shmt2Q9CZN7 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Shmt2Q9CZN7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Shmt2Q9CZN7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Shmt2Q9CZN7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Shmt2Q9CZN7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Shmt2Q9CZN7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Shmt2Q9CZN7 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Shmt2Q9CZN7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Shmt2Q9CZN7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Shmt2Q9CZN7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Shmt2Q9CZN7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Shmt2Q9CZN7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Shmt2Q9CZN7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Shmt2Q9CZN7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Shmt2Q9CZN7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Shmt2Q9CZN7 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Shmt2Q9CZN7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Shmt2Q9CZN7 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Shmt2Q9CZN7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Shmt2Q9CZN7 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Shmt2Q9CZN7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Shmt2Q9CZN7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Shmt2Q9CZN7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Shmt2Q9CZN7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Shmt2Q9CZN7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Shmt2Q9CZN7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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