Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CYI0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CYI0 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CYI0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9CYI0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9CYI0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CYI0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CYI0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CYI0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CYI0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CYI0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CYI0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CYI0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CYI0 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CYI0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CYI0 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CYI0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CYI0 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CYI0 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CYI0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CYI0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CYI0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CYI0 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CYI0 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CYI0 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CYI0 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CYI0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CYI0 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CYI0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CYI0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CYI0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CYI0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CYI0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CYI0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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