Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms