Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ndufaf1Q9CWX2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms