Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9CRC3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms