Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Atp6v0e1Q9CQD8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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