Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Use1Q9CQ56 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Use1Q9CQ56 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Use1Q9CQ56 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Use1Q9CQ56 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Use1Q9CQ56 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Use1Q9CQ56 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Use1Q9CQ56 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Use1Q9CQ56 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Use1Q9CQ56 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Use1Q9CQ56 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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