Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms